Projektdaten

---

SepMap - Unravelling the murine Transcriptome of Sepsis-Associated Encephalopathy

---

Sepsis-assoziierte Enzephalopathie (SAE) ist eine übliche und schwerwiegende Komplikation nach einer überlebten, schweren Sepsis Erkrankung. Die chronische Phase ist u. A durch Gedächtniseinschränkungen und Sprachstörungen charakterisiert. Während die Anzahl der Sepsisfälle ansteigt, nimmt die Sterblichkeit ab, sodass die Anzahl an Erkrankten mit SAE steigt. Da Sepsis eine häufige Komplikation während einer Covid-19 Infektion ist, ist die Anzahl der von SAE Betroffenen weiter sprunghaft angestiegen. Trotz der großen Anzahl an Betroffenen sind die ursächlichen Mechanismen der SAE nur teilweise verstanden und spezifische Therapien nicht vorhanden. Aus diesem Grund untersuchen wir die Pathomechanismen der SAE am polymikrobiellen Sepsis Mausmodell. Im IMPULSE Projekt wurden räumliche Transkriptomanalysen mit Maushirnschnitten durchgeführt. Im Gegensatz zu herkömmlichen Transkriptomanalysen bleibt bei dieser Technik die räumliche Struktur der Transkriptomdaten erhalten. Es ermöglicht somit den spezifischen Einfluss von Sepsis auf verschiedene Gehirnareale zu untersuchen oder das Mikroumfeld um Immunzellen herum zu charakterisieren. Die räumliche Auflösung der Methode liegt bei einem Durchmesser von 55 µM, der das Transkriptom von 1 bis 10 Zellen umfassen kann. Um diese Auflösung weiter zu erhöhen wird diese Methode mit Einzellzellkern Transkriptomanalysen gepaart. Durch Datenintegration ist es dann möglich auch spezielle Subpopulationen zu identifizieren und zu lokalisieren.